RT-PCR是real-time PCR的话,和qPCR是一样的,都是荧光定量PCR。相比普通PCR,会加入染料,便于收集荧光信号。结果可以得出相对/绝对 浓度等多组数据,然后根据你的目的,对实际数据进行分析。还能通过ntc的ct值判断实验合不合格。
反向pcr和rtpcr一样。根据查询相关资料信息,国际上的约定俗成的是:RT-PCR特指反转录PCR,而Real-timePCR一般缩写为qPCR(实时荧光定量PCR)。
前者通常要加上real time,或者写成qPCR,如果没有加的就是普通的RT-PCR了。
rtpcr时提取rna的浓度和纯度要求:浓度20ng/ul以上足够了,如果用的是组织提取,浓度一般很高,可以达到几百甚至几千。如果你用的是病毒、少量细胞,浓度低一些也没有关系。纯度需要用仪器测一下。260/280理论值应该有0以上,260/230值2以上基本合格。
在进行RT-PCR实验时,首要关注的是保护RNA的稳定性。在提取总RNA的过程中,务必谨慎操作,避免mRNA断裂,确保RNA的完整性。为了确保实验的准确性,阴性对照的设置至关重要。它能帮助排除非特异性扩增的干扰,确保实验结果的可靠性。内参的选择和使用是为了精确定量目标RNA。
最好采用巢式 PCR,即先扩增出一较长的片段,再以该片段为模板扩增出较短的片段,以保证探针的特异性,如下图所示:上游引物下游引物Ⅱ T7 启动子序列下游引物Ⅰ(2)PCR 先用上游引物和下游引物Ⅰ进行PCR,再以PCR 产物为模板,用上游引物和下游引物Ⅱ-T7进行二次PCR(具体操作参见PCR章节)。
⑹70度10分钟结束反应(此处是灭活酶活性,避免对后续实验产生干扰),产物置冰上进行下一步PCR实验,余下的-70度保存。3 RT-PCR的引物设计RT-PCR引物设计和一般PCR引物设计可以遵循同样的原则。细心地进行引物设计是PCR中最重要的一步。理想的引物对只同目的序列两侧的单一序列而非其他序列退火。
RT 我是用PCR仪来控制温度和时间的,所以RT是在PCR反应管中作的。 操作过程中要戴一次性手套,并经常换手套。
正式实验开始前,冰上解冻各个试剂【注意:SYBR Green I Master 需要避光放置】反转录 实验操作时注意:所有RNA相关的操作均需要佩戴手套,防止RNase污染。严格按照试剂盒使用说明进行相关操作。按照体系配方在冰上的Rnasefree的灭菌PCR管中配置Templateprimer mix,总体系13ul。
RT-PCR操作步骤详解:首先,从组织或细胞中提取总RNA,确保RNA的质量和量适宜。通常,提取过程会涉及使用DEPC H2O稀释RNA样本,以及Oligo(dT)12-18作为引物。
加标准marker电泳,用照胶自动分析系统计算,可以大致定量,得其质量浓度;2,更准的是,回收PCR产物,用紫外分光光度计准确测定其质量浓度。“先算出模板链的质量然后用2的N-1次方算出扩增后DNA的数量相乘”,这是有误区的,实际的PCR反应不是理想的指数扩增过程,尤其是循环到了一定次数后。
体外转录RNA: 利用实时荧光定量PCR生成的PCR 产物可利用包含5’ T7启动子的序列和包含 3’ poly(T) 的逆转录引物重新扩增。体外转录反应生成多聚腺苷酸化正义mRNA。纯化后可将其准确定量并稀释,用于生成标准曲线。
点击start run,开始运行PCR反应,此时可在软件上实时监测样品扩增情况。
相对定量可以分为比较Ct法和其他一些相对方法。比较Ct指的是通过与内参基因Ct值之间的相差来计算基因表达差异,也称之是2-DDCt。1绝对定量从标准曲线获得线性方程:Y=-432X+3638;R2=0.995,E=95%,所以可以进行数据分析。
1、rtpcr和实时荧光定量pcr区别就是过程不同,具体如下:RT-PCR一般情况下是指反转录PCR。基本操作过程是将所提取的RNA进行反转录,然后将所获得的cDNA作为模板,设计引物进行扩增,是一种检测基因表达的常用方法。
2、RT-PCR实验过程可以根据需要采取一步法或两步法。两步法的流程更为细致,首先在反转录缓冲液中进行cDNA合成,然后将反应产物的1/10分出进行PCR反应。每一步都在最适宜的条件下执行,以保证效率和准确性。
3、所说的PCR应该就是最常规的PCR,以DNA为模板,通过上下游引物,实现DNA的扩增。RT-PCR一般情况下是指反转录PCR(reverse transcription),尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也(realtime fluores-cence quantitative PCR)也简称RT-PCR,但是这是不对的,不推荐。
4、rtpcr的基本含义是逆转录-聚合酶链反应。根据查询相关公开信息显示,RT-PCR即逆转录-聚合酶链反应。原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。
5、所说的PCR应该就是最常规的PCR,以DNA为模板,通过上下游引物,实现DNA的扩增。RTPCR一般情况下是指反转录PCRreverse,transcription,尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也realtime,fluores,cencequantitativePCR也简称RTPCR,但是这是不对的,不推荐。
这个对照是自己定义的,要在method里面说明,一般是选择阴性对照。
阴性对照用DEPC处理水代替RNA模板,其余成分相同。将上述反应成分加于0.5ml的EP管中,混匀,短时离心。将各反应管放入PCR扩增仪上,37℃ 60min,70℃变性15min,反转录产物于4℃保存备用。PCR扩增。
RNaseP引物和探针是以人的RNaseP基因为靶基因的,因此对于人的核酸可以作为内部阳性对照。2)对于每一个过程中包括的所有引物和探针,均设立无模板对照(NTC)和阳性模板对照(PTC)。3)人类样本对照(HSC)提供了次级阴性对照,以便确认核酸提取过程和试剂的完整性。建立反应反应检测混合物充分混合后加入到96孔板中。
1、mRNA一般使用RT-qPCR进行“定量”PCR。步骤前三步同于“半定量”PCR,第四步PCR的时候,用的PCR试剂,必须带有荧光素,用实时定量PCR仪检测。通过数据分析,得到mRNA的含量。
2、通过PCR可以鉴定到种 具体步骤:1将培养过的微生物(最好是青年时代的)提取基因组(这步不清楚再问我)2 通过PCR扩增,3 测定基因序列 4 和已知的基因图库上的序列比较,就可以确定是哪一个种 不过现在一般不采用基因组来比较,这样工程量太大。比较16SRNA是比较常用的方法。相对简单,准确度高。
3、它具有特异、敏感、产率高、快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点;能在一个试管内将所要研究 的目的基因或某一DNA片段于数小时内扩增至十万乃至百万倍,使肉眼能直接观察和判断;可从一根毛发、一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的DNA供分析研 究和检测鉴定。